mrjСовременная ревматологияModern Rheumatology Journal1996-70122310-158XIMA-PRESS, LLC10.14412/1996-7012-2021-5-114-120mrj-1210Research ArticleОБЗОРЫREVIEWSФармакоинформационные исследования хондропротекторовPharmacoinformation studies of chondroprotectorshttps://orcid.org/0000-0002-6068-3080ЛилаА. М.LilaA. M.

115522, Москва, Каширское шоссе, 34А

125993, Москва, ул. Баррикадная, 2/1, стр. 1

34A, Kashirskoe Shosse, Moscow 115522

2/1, Barrikadnaya Street, Build. 1, Moscow 125993

https://orcid.org/0000-0002-2659-7998ТоршинИ. Ю.TorshinI. Yu.

119333, Москва, ул. Вавилова, 42, корп. 2

42, Vavilova Street, Build. 2

https://orcid.org/0000-0001-7507-191XГромовА. Н.GromovA. N.

119333, Москва, ул. Вавилова, 42, корп. 2

42, Vavilova Street, Build. 2, Moscow 119333

https://orcid.org/0000-0002-8958-6495СеменовВ. А.SemenovV. A.

650056, Кемерово, ул. Ворошилова, 22А

22A, Voroshilova Street, Kemerovo 650056

https://orcid.org/0000-0002-7663-710XГромоваО. А.GromovaO. A.

Ольга Алексеевна Громова

119333, Москва, ул. Вавилова, 42, корп. 2

Olga Alekseevna Gromova

42, Vavilova Street, Build. 2, Moscow 119333

unesco.gromova@gmail.comФГБНУ «Научно-исследовательский институт ревматологии им. В.А. Насоновой»; Кафедра ревматологии ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава РоссииРоссияV.A. Nasonova Research Institute of Rheumatology; Department of Rheumatology, Russian Medical Academy of Continuing Professional EducationRussian FederationИнститут фармакоинформатики Федерального исследовательского центра «Информатика и управление» Российской академии наукРоссияInstitute of pharmacoinformatics, Federal Research Center «Informatics and Management», Russian Academy of SciencesRussian FederationФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииРоссияKemerovo State Medical University, Ministry of Health of RussiaRussian FederationИнститут фармакоинформатики Федерального исследовательского центра «Информатика и управление» Российской академии наукРоссияInstitute of pharmacoinformatics, Federal Research Center «Informatics and Management»Russian Federation202119102021155114120Copyright © Лила А.М., Торшин И.Ю., Громов А.Н., Семенов В.А., Громова О.А., 20212021Лила А.М., Торшин И.Ю., Громов А.Н., Семенов В.А., Громова О.А.Lila A.M., Torshin I.Y., Gromov A.N., Semenov V.A., Gromova O.A.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://mrj.ima-press.net/mrj/article/view/1210

Фармакоинформационный подход к оценке и моделированию лекарственных средств подразумевает использование современных методов интеллектуального анализа данных. Эти методы включают: 1) анализ больших данных (отбор текстов научных публикаций, поиск новых биомаркеров); 2) компьютерный анализ текстов (автоматическая классификация текстов по содержанию, выявление псевдонаучных текстов); 3) анализ метрических карт (визуализация и анализ сложных закономерностей, в том числе кластеризация) и 4) хемоинформационный анализ, включающий оценку действия лекарств на транскриптом, протеом и микробиом человека. В статье приведены примеры применения этих методов фармакоинформатики к хондропротекторам, содержащим стандартизированные формы хондроитина сульфата и глюкозамина сульфата.

The pharmacoinformation approach to the assessment and modeling of drugs involves the use of modern methods of data mining. These methods include: 1) analysis of big data (selection of texts of scientific publications, search for new biomarkers); 2) computer analysis of texts (automatic classification of texts by content, identification of pseudoscientific texts); 3) analysis of metric maps (visualization and analysis of complex patterns, including clustering) and 4) chemoinformation analysis, including the assessment of the effect of drugs on the transcriptome, proteome and microbiome of a person. The article provides examples of the application of these methods of pharmacoinformatics to chondroprotectors containing standardized forms of chondroitin sulfate and glucosamine sulfate.

хондропротекторыхондроитина сульфатХондрогардглюкозамина сульфатфармакоинформатикаанализ прецедентовалгебраический подход к распознаваниютопологическая теория распознаванияchondroprotectorschondroitin sulfateHondroguardglucosamine sulfatepharmacoinformaticsanalysis of precedentsalgebraic approach to recognitiontopological recognition theoryРабота выполнена при поддержке гранта Российского фонда фундаментальных исследований 19-07-00356.ReferencesЖуравлёв ЮИ, Рудаков КВ, Торшин ИЮ. Алгебраические критерии локальной разрешимости и регулярности как инструмент исследования морфологии аминокислотных последовательностей. Труды Московского физико-технического института. 2011; 3(4):45-54.Zhuravlev YuI, Rudakov KV, Torshin IYu. Algebraic criteria of local solvability and regularity as a tool for studying the morphology of amino acid sequences. Trudy Moskovskogo fiziko-tekhnicheskogo instituta. 2011;3(4): 45-54. (In Russ.).Torshin IYu., Rudakov KV. On the theoretical basis of the metric analysis of poorly formalized problems of recognition and classification. Pattern Recognition and Image Analysis (Advances in Mathematical Theory and Applications). 2015;25(4):577-87.Torshin IYu., Rudakov KV. On the theoretical basis of the metric analysis of poorly formalized problems of recognition and classification. Pattern Recognition and Image Analysis (Advances in Mathematical Theory and Applications). 2015;25(4):577-87.Torshin IYu, Rudakov KV. On the Procedures of Generation of Numerical Features Over Partitions of Sets of Objects in the Problem of Predicting Numerical Target Variables. Pattern Recognition and Image Analysis. 2019;29(4): 654-67.Torshin IYu, Rudakov KV. On the Procedures of Generation of Numerical Features Over Partitions of Sets of Objects in the Problem of Predicting Numerical Target Variables. Pattern Recognition and Image Analysis. 2019;29(4): 654-67.Torshin IYu, Rudakov KV. On the Application of the Combinatorial Theory of Solvability to the Analysis of Chemographs. Part 1: Fundamentals of Modern Chemical Bonding Theory and the Concept of the Chemograph. Pattern Recognition and Image Analysis. 2014;24(1):11-23.Torshin IYu, Rudakov KV. On the Application of the Combinatorial Theory of Solvability to the Analysis of Chemographs. Part 1: Fundamentals of Modern Chemical Bonding Theory and the Concept of the Chemograph. Pattern Recognition and Image Analysis. 2014;24(1):11-23.Torshin IYu, Rudakov KV. On metric spaces arising during formalization of recognition and classification problems. Part 1: Properties of compactness. Pattern Recognition and Image Analysis. 2016;26:274-84.Torshin IYu, Rudakov KV. On metric spaces arising during formalization of recognition and classification problems. Part 1: Properties of compactness. Pattern Recognition and Image Analysis. 2016;26:274-84.Torshin IYu. The study of the solvability of the genome annotation problem on sets of elementary motifs. Pattern Recognition and Image Analysis. 2011;21:652-62Torshin IYu. The study of the solvability of the genome annotation problem on sets of elementary motifs. Pattern Recognition and Image Analysis. 2011;21:652-62Torshin IYu, Rudakov KV. Combinatorial analysis of the solvability properties of the problems of recognition and completeness of algorithmic models. part 1: factorization approach. Pattern Recognition and Image Analysis. 2017;27(1):16-28.Torshin IYu, Rudakov KV. Combinatorial analysis of the solvability properties of the problems of recognition and completeness of algorithmic models. part 1: factorization approach. Pattern Recognition and Image Analysis. 2017;27(1):16-28.Torshin IYu. Optimal dictionaries of the final information on the basis of the solvability criterion and their applications in bioinformatics. Pattern Recognition and Image Analysis.2013;23(319-27).Torshin IYu. Optimal dictionaries of the final information on the basis of the solvability criterion and their applications in bioinformatics. Pattern Recognition and Image Analysis.2013;23(319-27).Torshin, I.Y., Rudakov, K.V. On metric spaces arising during formalization of problems of recognition and classification. Part 2: Density properties. Pattern Recognition and Image Analysis. 2016;26:483-96.Torshin, I.Y., Rudakov, K.V. On metric spaces arising during formalization of problems of recognition and classification. Part 2: Density properties. Pattern Recognition and Image Analysis. 2016;26:483-96.Торшин ИЮ, Громова ОА, Кобалава ЖД. Об ошибках метаанализов сердечнососудистых эффектов омега-3 ПНЖК. Часть 2. Интеллектуальный анализ данных и метаанализ клинически однородных исследований. Эффективная фармакотерапия. 2019;15(1):36-43.Torshin IYu, Gromova OA, Kobalava ZhD. On the errors of meta-analyses of the cardiovascular effects of omega-3 PUFA. Part 2. Data mining and meta-analysis of clinically homogeneous studies. Effektivnaya farmakoterapiya. 2019;15(1):36-43. (In Russ.).Торшин ИЮ, Лила АМ, Наумов АВ и др. Метаанализ клинических исследований эффективности лечения остеоартита препаратом Хондрогард. Современная Фармакоэкономика и Фармакоэпидемиология. 2020;13(4):18-29.Torshin IYu, Lila AM, Naumov AV, et al. Meta-analysis of clinical studies on the effectiveness of treatment of osteoarthritis with Chondrogard. Sovremennaya Farmakoekonomika i Farmakoepidemiologiya. 2020;13(4): 18-29. (In Russ.).Громова ОА, Торшин ИЮ, Лила АМ и др. Стандартизированные формы хондроитина сульфата как патогенетическое средство лечения остеоартрита в контексте постгеномных исследований. Современная ревматология. 2021;15(1):136-43.Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, et al. Standardised Forms of Chondroitin Sulfate as a Pathogenetic Treatment of Osteoarthritis in the Context of Post-Genomic Studies. Sovremennaya revmatologiya = Modern Rheumatology Journal. 2021;15(1):136-43. (In Russ.). doi:10.14412/1996-7012-2021-1-136-143Торшин ИЮ, Лила АМ, Наумов АВ и др. Перспективы персонификации профилактики и терапии остеоартрита на основании анализа коморбидного фона, генетических полиморфизмов и микроэлементного статуса. Современная фармакоэкономика и фармакоэпидемиология. 2021;14(1):28-39.Torshin IYu, Lila AM, Naumov AV, et al. Prospects of personification of prevention and therapy of osteoarthritis based on the analysis of comorbid background, genetic polymorphisms and trace element status. Sovremennaya farmakoekonomika i farmakoepidemiologiya. 2021;14(1):28-39. (In Russ.).Громова ОА, Торшин ИЮ, Лила АМ и др. Дифференциальный хемореактомный анализ глюкозамина сульфата и нестероид- ных противовоспалительных препаратов: перспективные синергичные комбинации. Современная ревматология. 2018;12(2):36-43.Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, et al. Differential chemoreactome analysis of glucosamine sulfate and non-steroidal antiinflammatory drugs: promising synergistic drug combinations. Sovremennaya revmatologiya = Modern Rheumatology Journal. 2018;12(2): 36-43. (In Russ.). doi:10.14412/1996-7012-2018-2-36-43Громова ОА, Торшин ИЮ, Лила АМ и др. Хемореактомный анализ антитромботических эффектов глюкозамина сульфата и нестероидных противовоспалительных препаратов. Современная ревматология. 2019;13(1):129-34.Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, et al. Chemoreactome analysis of the antithrombotic effects of glucosamine sulfate and nonsteroidal anti-inflammatory drugs. Sovremennaya revmatologiya = Modern Rheumatology Journal.2019;13(1):129-34. (In Russ.). doi: 10.14412/1996-7012-2019-1-129-134Торшин ИЮ, Громова ОА, Наумов АВ, Лила АМ. Хемотранскриптомный анализ молекулы глюкозамина сульфата в контексте постгеномной фармакологии. Русский медицинский журнал. 2019;1(1):2-9.Torshin IYu, Gromova OA, Naumov AV, Lila AM. Chemo transcriptomic analysis of the glucosamine sulfate molecule in the context of postgenomic pharmacology. Russkii meditsinskii zhurnal. 2019;1(1):2-9. (In Russ.).Торшин ИЮ, Громова ОА, Лила АМ и др. Результаты постгеномного анализа молекулы глюкозамина сульфата указывают на перспективы лечения коморбидных заболеваний. Современная ревматология. 2018;12(4):129-36.Torshin IYu, Gromova OA, Lila AM, et al. The results of postgenomic analysis of a glucosamine sulfate molecule indicate the prospects of treatment for comorbidities. Sovremennaya revmatologiya = Modern Rheumatology Journal. 2018;12(4):129-36. (In Russ.). doi: 10.14412/1996-7012-2018-4-129-136Торшин ИЮ, Громова ОА, Лила АМ и др. Таргетное действие глюкозамина сульфата при сочетании остеоартрита и опухолевой патологии. Русский медицинский журнал. 2019;(6):23-30.Torshin IYu, Gromova OA, Lila AM, et al. Targeted effect of glucosamine sulfate in the combination of osteoarthritis and tumor pathology. Russkii meditsinskii zhurnal. 2019; (6):23-30. (In Russ.).Громова ОА, Торшин ИЮ, Наумов АВ, Максимов ВА. Хемомикробиомный анализ глюкозамина сульфата, пребиотиков и нестероидных противовоспалительных препаратов. Современная фармакоэкономика и фармакоэпидемиология. 2020;13(3):270-82.Gromova OA, Torshin IYu, Naumov AV, Maksimov VA. Chemomicrobiomic analysis of glucosamine sulfate, prebiotics and nonsteroidal anti-inflammatory drugs. Sovremennaya farmakoekonomika i farmakoepidemiologiya.2020;13(3):270-82. (In Russ.).Громова ОА, Торшин ИЮ, Зайчик БЦ и др. О различиях в стандартизации лекарственных препаратов на основе экстрактов хондроитина сульфата. Современная фармакоэкономика и фармакоэпидемиология.2021;14(1):40-52.Gromova OA, Torshin IYu, Zaichik BTs, et al. About the differences in the standardization of medicines based on extracts of chondroitin sulfate. Sovremennaya farmakoekonomika i farmakoepidemiologiya. 2021;14(1):40-52. (In Russ.).Торшин ИЮ, Лила АМ, Лиманова ОА, Громова ОА. Перспективы применения хондроитина сульфата и глюкозамина сульфата при остеоартрите в сочетании с патологией почек и мочевыделительной системы. Современная Фармакоэкономика и Фармакоэпидемиология. 2020;13(1):23-34.Torshin IYu, Lila AM, Limanova OA, Gromova OA. Prospects for the use of chondroitin sulfate and glucosamine sulfate in osteoarthritis in combination with kidney and urinary system pathology. Sovremennaya Farmakoekonomika i Farmakoepidemiologiya. 2020;13(1):23-34. (In Russ.).Громова ОА, Торшин ИЮ, Семенов ВА и др. О неврологических ролях хондроитина сульфата и глюкозамина сульфата:систематический анализ. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2019; 11(3):137-43.Gromova OA, Torshin IYu, Semenov VA, et al. On the neurological roles of chondroitin sulfate and glucosamine sulfate: a systematic analysis. Nevrologiya, neiropsikhiatriya, psikhosomatika = Neurology, Neuropsychiatry, Psychosomatics. 2019;11(3):137-43. (In Russ.). doi: 10.14412/2074-2711-2019-3-137-143Громова ОА, Торшин ИЮ, Лила АМ и др. Систематический анализ исследований противоопухолевых эффектов хондропротекторов глюкозамина сульфата и хондроитина сульфата. Русский медицинский журнал. 2019;(4):4-10.Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, et al. Systematic analysis of studies of antitumor effects of chondroprotectors glucosamine sulfate and chondroitin sulfate. Russkii meditsinskii zhurnal. 2019;(4):4-10. (In Russ.).Торшин ИЮ, Лила АМ, Громова ОА и др. Об антикоагулянтных и антиагрегантных свойствах молекулы глюкозамина сульфата. Современная ревматология. 2019;13(3):135-41.Torshin IYu, Lila AM, Gromova OA, et al. On the anticoagulant and antiaggregatory properties of a glucosamine sulfate molecule. Sovremennaya revmatologiya = Modern Rheumatology Journal. 2019;13(3):135-41. (In Russ.). doi: 10/14412/1996-7012-2019-3-135-141Торшин ИЮ, Лила АМ, Громова ОА. Антикоагулянтные и антиагрегантные эффекты хондроитина сульфата. Русский медицинский журнал. 2020;(7):44-8.Torshin IYu, Lila AM, Gromova OA. Anticoagulant and antiplatelet effects of chondroitin sulfate. Russkii meditsinskii zhurnal. 2020;(7):44-8. (In Russ.).Громова ОА, Торшин ИЮ, Лила АМ, Громов АН. Молекулярные механизмы глюкозамина сульфата при лечении дегенеративно-дистрофических заболеваний суставов и позвоночника: результаты протеомного анализа. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2018;10(2):38-44.Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, Gromov AN. Molecular mechanisms of action of glucosamine sulfate in the treatment of degenerative-dystrophic diseases of the joints and spine: results of proteomic analysis. Nevrologiya, neiropsikhiatriya, psikhosomatika = Neurology, Neuropsychiatry, Psychosomatics. 2018;10(2):38-44 (In Russ.). doi:10.14412/2074-2711-2018-2-38-44Громова ОА, Торшин ИЮ, Лила АМ и др. Молекулярные механизмы миопротективного действия хондроитина сульфата и глюкозамина сульфата при саркопении. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2019;11(1):117-24.Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, et al. Molecular mechanisms of myoprotective action of chondroitin sulfate and glucosamine sulfate in sarcopenia. Nevrologiya, neiropsikhiatriya, psikhosomatika = Neurology, Neuropsychiatry, Psychosomatics. 2019;11(1):117-24. (In Russ.). doi: 10.14412/2074-2711-2019-1-117-124Громова ОА, Торшин ИЮ, Лила АМ и др. О безопасности применения глюкозамина сульфата у пациентов с резистентностью к инсулину. Consilium medicum. 2019;21(4):2-30.Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, et al. About the safety of the use of glucosamine sulfate in patients with insulin resistance. Consilium medicum. 2019;21(4):2-30. (In Russ.).Лила АМ, Громова ОА, Торшин ИЮ и др. Молекулярные эффекты хондрогарда при остеоартрите и грыжах межпозвоночного диска. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2017;9(3):88-97.Lila AM, Gromova OA, Torshin IYu, et al. Molecular effects of chondroguard in osteoarthritis and herniated discs. Nevrologiya, neiropsikhiatriya, psikhosomatika = Neurology, Neuropsychiatry, Psychosomatics. 2017;9(3): 88-97. (In Russ.). doi: 10.14412/2074-2711-2017-3-88-97Лила АМ, Торшин ИЮ, Громова ОА. Стоит ли переосмыслить полученный полвека назад положительный опыт применения хондроитинсульфатов при атеросклерозе? Современная фармакоэкономика и фармакоэпидемиология. 2020;13(2):184-91.Lila AM, Torshin IYu, Gromova OA. Is it worth rethinking the positive experience of using chondroitin sulfates for atherosclerosis obtained half a century ago? Sovremennaya farmakoekonomika i farmakoepidemiologiya. 2020;13(2):184-91. (In Russ.).Торшин ИЮ, Громова ОА, Нечаева ГИ и др. Систематический анализ молекулярнобиологических механизмов поддержки хондроитина сульфатом метаболизма соединительной ткани. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2021;13(1):154-62.Torshin IYu, Gromova OA, Nechaeva GI, et al. Systematic analysis of molecular biological mechanisms for supporting connective tissue metabolism with chondroitin sulfate. Nevrologiya, neiropsikhiatriya, psikhosomatika = Neurology, Neuropsychiatry, Psychosomatics. 2021;13(1):154-62. (In Russ.). doi: 10.14412/2074-2711-2021-1-154-162

The authors declare that there are no conflicts of interest present.